Študija je opredelila bakterije, povezane s prezgodnjim porodom

Raziskovalci na Državni univerzi Severne Karoline so ugotovili, da lahko v istem vaginalnem mikrobiomu sobiva več vrst Gardnerelle, bakterij, ki so včasih povezane z bakterijsko vaginozo (BV) in prezgodnjim porodom. Ugotovitve, objavljene v reviji mSystems, prispevajo k boljšemu razumevanju vpliva Gardnerelle na zdravje ljudi.

Gardnerela je skupina anaerobnih bakterij, ki so pogoste v vaginalnem mikrobiomu. Povišane ravni teh bakterij so značilnost bakterijske vaginoze in so povezane s povečanim tveganjem za prezgodnji porod, vendar jih najdemo tudi pri ženskah brez znakov bolezni.

"Poskušali smo razumeti raznolikost znotraj Gardnerelle," pravi Ben Callahan, izredni profesor za zdravje prebivalstva in patobiologijo na Državni univerzi Severne Karoline in soavtor članka.

"Znanstveniki so šele pred kratkim začeli preučevati posamezne vrste Gardnerelle, zato še ne vemo, ali imajo različne vrste različne učinke na zdravje. Naš glavni cilj je bil preučiti ekologijo Gardnerelle."

Edinstven izziv sekvenciranja vaginalnega mikrobioma je, da so vsi vzorci sestavljeni predvsem iz DNK gostitelja, zaradi česar je ekstrakcija mikrobnih podatkov dražja in delovno intenzivnejša. Prva naloga raziskovalne skupine je bila razviti metodologijo, ki bi omogočila identifikacijo različnih vrst Gardnerella iz podatkov mikrobioma.

»Orodja, ki so na voljo za preučevanje vaginalnega mikrobioma, obravnavajo vse vrste Gardnerella kot eno samo vrsto,« je dejala Hannah Berman, podoktorska sodelavka na Državni univerzi Severne Karoline in glavna avtorica članka. »Za to delo smo morali zgraditi lastno bazo podatkov o genomih Gardnerella in razviti metodo za identifikacijo različnih vrst Gardnerella. Upajmo, da bo to omogočilo tudi več raziskovalcem, da preučijo raznolikost Gardnerella.«

Raziskovalna skupina je preučila podatke sekvenciranja iz treh kohort: dveh naključnih populacij nosečnic in ene populacije z anamnezo prezgodnjega poroda. Analizirali so metagenomska zaporedja bakterije Gardnerella iz vzorcev, da bi ugotovili, ali obstaja povezava med specifičnimi vrstami bakterije Gardnerella in prezgodnjim porodom.

Čeprav niso našli "nedvomnega dokaza", so naredili dve presenetljivi ugotovitvi.

Najprej so med vzorci identificirali potencialno 14. vrsto Gardnerelle – pred tem delom je bilo identificiranih le 13 vrst.

Ugotovili so tudi, da je v večini vzorcev, ki so vsebovali Gardnerello, v istem mikrobiomu sobivalo več vrst Gardnerelle: v posameznih vzorcih so našli od dve do vseh 14 znanih vrst Gardnerelle.

»Običajno, če vrsta bakterij kolonizira okolje, pričakujemo, da bo izključila bližnje sorodnike, ki zasedajo isto ekološko nišo in porabljajo iste vire,« pravi Callahan. »Pogosto pravim, da je pri bakterijah vse mogoče, vendar je to še vedno nenavadno. Videli smo tudi, da ko je skupna mikrobna obremenitev večja, Gardnerella predstavlja večji del te obremenitve.«

"Dokazi, da je Gardnerella povezana s prezgodnjim porodom, se še naprej kopičijo, vendar so podrobnosti te povezave zapletene. V tem delu nismo našli ene škodljive vrste Gardnerelle – morda so škodljive vse. To še zdaleč ni konec zgodbe."

Raziskovalci upajo, da bodo nadalje preučevali vprašanja sobivanja vrst in sestave mikrobioma.

»Vaginalni mikrobiom je podcenjen,« pravi Callahan. »Na primer, pogosto v njem prevladuje ena vrsta Lactobacillusa, ki ustvarja okolje, ki izključuje druge bakterije. Ko te ni več, je tu Gardnerella. Kako torej te bakterije medsebojno delujejo?«

"Odgovori na ta vprašanja bi lahko vodili do učinkovitejšega zdravljenja bakterijske vaginoze in načinov za napovedovanje in preprečevanje prezgodnjega poroda. To delo je pomemben korak v tem procesu."