Funkcionalna magnetna resonanca (MRI) temelji na povečanju pretoka krvi v možganih kot odziv na povečano nevronsko aktivnost v skorji, ko so izpostavljeni ustreznemu dražljaju. Kartiranje možganske aktivnosti nam omogoča prepoznavanje področij nevronske aktivacije, ki nastanejo kot odziv na stimulacijo (motorične, senzorične in druge dražljaje).