Troponinski kompleks je del mišičnega kontraktilnega sistema. Sestavljajo ga trije proteini: troponin T, ki tvori vez s tropomiozinom (molekulska masa 3700), troponin I (molekulska masa 26.500), ki lahko zavira aktivnost ATPaze, in troponin C (molekulska masa 18.000), ki ima pomembno afiniteto za Ca2+.