Vsi probiotiki so razdeljeni na več skupin, odvisno od tega, kaj je podlaga za razvrstitev. Probiotični sestavek lahko vsebuje več komponent, pri čemer so izolirani monokomponentni pripravki, ki imajo samo eno specifično vrsto bakterij. Ti mikroorganizmi so nedvomno koristni za črevesje, zlasti za mikrofloro.