Menstrualnega cikla odraža aktivnost hipotalamus-hipofiza-jajčnikov, ki je prikazan strukturne in funkcionalne spremembe v reproduktivnega trakta: maternice, jajcevodov, endometrij, vagina. Vsak ciklus se zaključi z menstrualno krvavitvijo, pri čemer se prvi dan šteje za začetek cikla.