Ponavljajoči se cistitis pri ženskah zahteva kompleksno zdravljenje, tj. kombinacijo etioloških in patogenetskih dejavnikov. Cilj mora biti odprava vzrokov bolezni.
Vzroki za ponavljajoči se cistitis pri ženskah so v 95 % povezani z enim samim mikroorganizmom. Najpogostejši povzročitelj so gramnegativne enterobakterije, in sicer Escherichia coli.