Ponavljajoči cistitis pri zdravljenju žensk vključuje kompleksno, to je kombinacijo etioloških in patogenetskih dejavnikov. Cilj bi moral biti odprava vzrokov bolezni.
Vzroki ponavljajočega se cistitisa pri ženskah pri 95% so povezani z enim mikroorganizmom. Najpogostejši povzročitelj bolezni je gram negativne enterobakterije, in sicer Escherichia coli.