Klopni encefalitis povzroča flavivirus, ki ga prenašajo iksodidni klopi, opisani so primeri okužbe s svežim mlekom. Po 10-dnevni inkubacijski dobi se kaže kot katar, vročina, glavobol, bolečine v sklepih in lezije osrednjega živčevja (encefalitis - 30 %, meningitis - 60 %, meningoencefalitis - 10 %). Cepljenje proti klopnemu encefalitisu na endemičnih območjih je zmanjšalo pojavnost.