Meningokoki so gramnegativne sferične celice s premerom 0,6-0,8 µm. V razmazih, pripravljenih iz materiala, odvzetega od pacienta, imajo obliko kavnega zrna, pogosto se nahajajo v parih ali tetradah ali naključno, pogosto znotraj levkocitov - nepopolna fagocitoza.