Motnje presnove kromoproteina se nanašajo na eksogene in endogene pigmente. Endogeni pigmenti (kromoproteini) so razdeljeni na tri vrste: hemoglobinogene, proteogene in lipidogene. Motnje se nanašajo na zmanjšanje ali povečanje količine pigmentov, oblikovanih v normi, ali pojav pigmentov, nastalih v patoloških razmerah.