Hipoksija je pomanjkanje kisika, stanje, ki se pojavi, ko telesna tkiva ne dobijo dovolj kisika ali ko je motena njegova izraba v procesu biološke oksidacije. Spremlja številna patološka stanja, je sestavni del njihove patogeneze in se klinično kaže s hipoksičnim sindromom, ki temelji na hipoksemiji.