Zapleti iz žolčnega trakta po presaditvi jeter se pojavijo v 10-20% primerov. Ti vključujejo strikture, izpuščanje žolča, fistulo in holangitis. Obstajajo lahko anastomozni zožitve zaradi tehnične napake, zaradi izteka žolčne vnetja in fibroza in zožitve, ki niso anastomoze, anastomozo tvorjen nad vrati v smeri jetra v nekaterih primerih ishemija vodov.