Zadevni o teh simptomov klopnega encefalitisa Bolniki so glavobol, slabost, bolehnost, mrzlica, vročinskih oblivov, znojenje, vrtoglavica, bolečine v zrkel in fotofobija, izguba apetita, bolečine v mišicah, kosti, hrbtenice, v zgornjih in spodnjih okončin , v spodnjem delu hrbta, v vratu in v sklepih.