Najpogosteje psevdomembranskega kolitisa razvija pod vplivom dolgotrajne uporabe antibiotikov ampicilin, linkomicin klinda-mitsina, cefalosporini, vsaj - penicilina, eritromicin, kloramfenikol, tetraciklin. Clostridium difficile - tvorijo spore grampozitivnim anaerobna bakterija, ki je sposobna proizvajati dve vrsti eksotoksini toksin A in toksin B. Obstajajo štirje glavni razlogi za razvoj psevdomembranskega kolitisa, povezanega s C. Difficile.