Pri primarni tuberkulozi so lezije običajno lokalizirane v bezgavkah, pljučih, pleur in včasih tudi v drugih organih: ledvicah, sklepih, kosteh, peritoneju. Območje specifičnega vnetja je lahko zelo majhno in med pregledovanjem ostane skrito. Z veliko škodo se običajno pojavi med kliničnimi in sevalni pregledi pacienta.