V nekaterih primerih, pogosteje pri ženskah, akutni pielonefritis se začne z akutno cistitis (palpitacije in boleče uriniranje, bolečine v mehurju, terminal hematurija). Drugi simptomi akutne mielonefrita: splošna oslabelost, utrujenost, bolečine v mišicah, glavobol, pomanjkanje apetita, slabost, bruhanje.