Zdravljenje cerebralnih abscesov je lahko konzervativno in kirurško. Način zdravljenja je odvisen predvsem od stopnje razvoja abscesa, njegove velikosti in lokalizacije. V fazi nastanka encefalitskega ostrenja (trajanje anamneze je do 2 tedna), kot tudi pri majhnih abscesih (<3 cm v premeru), je indicirano konzervativno zdravljenje.